如何處理系內競爭問題成為阿里巴巴內部研究重點外，B2B網招股書會否提到馬云的去留問題亦是關鍵。雅虎2005年8月時以78億元及雅虎中國權益換取入股阿里巴巴40％權益(35％投票權)，實則“暗渡陳倉”提出多項辛辣的條款，包括馬云行政總裁一職將保留至阿里巴巴整體上市或2010年10月，以及雅虎在2010年后于阿里巴巴董事會委任的人數將與管理層委任的相同(或較多)，因此是雅虎中國“被吞”還是阿里巴巴“被吞”還是懸念。

除5年期限留有一手外，雅虎入股時也提出阿里巴巴超過1000萬美元的單項及超過5000萬美元的多項相關投資均須由4人組成的董事會批準，投資其它業務往往也須董事會通過。現有4名董事中，1名由雅虎委任，另有1名由軟庫委任。
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